Согласно Устава образовательной организации, Высшим органом управления является Общее собрание учредителей в составе:
Фадеев Сергей Александрович, Садовникова Надежда Олеговна.
Исполнительным органом управления является Директор, который подотчетен Общему собранию учредителей и осуществляет текущее руководство образовательной организацией.
Директор: Фадеев Сергей Александрович
Структурных подразделений у ООО "Высшая школа психоанализа и пратической психологии" не имеется.